(👷)ある日、沖縄の海に奇怪な生物が現(xiàn )れた。オニヒトデを思(🔧)わせる「それ」は毒(dú )(🔬)液で漁(yú )師を負傷させ、(👋)瞬く間(🎏)に日本全(♑)域に広がった。それは伝(yún )説(shuì )のニライカナ(🙍)イの古代文明が環(🚥)境汚(🕌)染(rǎn )の解決の為(wéi )の生体浄化システ(🚑)ムとして生み出したが(⏺)、暴走(zǒu )したた(🔩)めに結果(🚨)としてニライ(❔)カナイの滅亡の一(🥔)因(yīn )と(🗞)な(🙂)った(🔝)怪(✋)獣ダガーラの復活の前兆であ(⛓)った(⏰)。　　(🔔)エリア(🕙)ス姉(😍)妹は地(dì )球の危機を察知して石(🤖)垣島へ飛ぶと、そこ(💝)にはニライカナ(🛎)イから来た(😊)小生物ゴーゴ(⛏)が出現し、(🃏)その尾(wěi )の装飾(shì )リングか(🔈)ら宝がある事(shì )を悟(📧)った本(🤥)土(tǔ )か(📛)らの密(💏)猟者(zhě )と、ゴーゴを(🐞)保護(hù )した地元の少女(nǚ )たちがいた(🖍)。エリアス姉妹は「(🚽)ニラ(🍁)イカナイの遺跡(📤)にはダガーラ(🛃)を倒す秘(mì )宝(bǎo )がある」(🕺)という伝説(shuì )(🚩)を知(⛴)っていた。少女(🔮)たちとエリアス姉妹(mèi )、(🚪)そして姉妹(mèi )と対立する黒(💨)い妖精ベルベラと密猟者はそ(🔍)れぞれ組んで海へ出(chū )る。　　ゴーゴの(🦐)手引きでニライカナイの遺跡であるピ(⛱)ラミッドが海(hǎi )から出現した。だが、(🌸)宝捜しを(🧔)し(🌮)ている頃、石(shí )垣(yuán )島にダガーラが(😛)上陸し暴れ出したため、エ(😕)リアス姉妹(mèi )はモスラを召(🕠)喚して(🤟)戦いを挑む。ダガ(🐊)ー(😎)ラと(🧖)モスラ(🕶)は(🥘)石垣島(dǎo )(🚖)か(👉)ら西表(biǎo )島(dǎo )まで空中戦を繰り広(guǎng )げ、遺跡のピラ(🙋)ミッド(👐)付近で海(🐣)中(zhōng )戦(zhàn )となり、モスラは海(hǎi )(🙎)での戦(zhàn )(🎁)いを(🛺)得意とするダガーラ(🈹)に海に引きず(🍑)り込まれた。そしてダガーラは「(✒)そ(🔷)れ」 = 無(wú )数の(😇)ベーレ(🧚)ム(🌵)をモスラに取(🍄)り付か(❔)せ、モスラは戦闘不能に陥った。エ(😀)リ(🔝)アスは必死にモスラ(☕)に(🕎)取り付いた(📜)ベー(🥩)レ(🚌)ムを(🦋)剥(😄)がそうと試みるが、あまりにも沢(🔷)山(shān )付いているため、全くきりがない。絶(jué )体(tǐ )絶命のピン(🧢)チに(🥑)陥(📏)った(🔵)モスラ(✉)、宝の(📐)発(fā )見(🔹)は急務(🙈)となった。　　遺跡(jì )の中のトラッ(🕰)プをくぐり抜けた少女たちと密猟者は、辿りついたホールでニラ(🗣)イカナ(💴)イ(⚾)の(✡)王女の立(lì )体映像から「ゴーゴが宝の主とし(📥)て少女(nǚ ) = 汐里を選(♑)ん(🔋)だ」事を告げられる。だが、ダガーラはピラミッドを襲撃してきた! 崩壊す(📼)るピラミ(🥪)ッド(🤱)の最中(🚲)、モスラはゴーゴの(👰)「命の水」の力(⚡)によ(👓)り、取(qǔ )り付いたベー(👥)レムは(♟)取り払われ、さ(😾)らにレインボーモスラとなってパワーアップし(👽)、再(🥇)びダガーラと再戦(🏳)する。さ(😾)っきま(😐)での状(zhuàng )況とは一変(✝)し、今度はモスラが優(yōu )位に立(☔)った。ダガーラが(🌂)再(zài )び海(🍮)中に潜った(🕥)時、モス(🕐)ラはアクアモス(🥘)ラに変身し、戦いの舞(📓)台は、海(🐥)底(dǐ )に移(🤑)った。ダガーラの攻撃をバリ(🌕)アーでガードし、ダ(♎)ガーラに強力な攻撃(😆)を与えるモス(🍪)ラ。さらに分身モードとなり、ダガーラ(🆚)の体内(nèi )から、ベ(🕤)ーレムを倒しな(💬)がら(🤪)攻(🎹)撃し、遂(suí )にダ(📢)ガーラは倒れ(👚)、(📊)そ(🍏)の後、ピラミッド(🎿)と共に消(🔋)滅。モスラも海から(👂)出てきた後(hòu )、元の姿のレインボーモスラ(🛀)に戻り、インフ(🏵)ァント島(⏳)に帰(guī )って行き(💡)、危機(jī )(😫)は(🍙)去っ(💭)たのであ(🎎)った。